Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf149Q3U2C5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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