Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms