Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms