Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms