Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd2Q149F1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms