Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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VgfQ0VGU4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VgfQ0VGU4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms