Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms