Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttc21bQ0HA38 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms