Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms