Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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