Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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