Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NrepQ07475 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
NrepQ07475 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NrepQ07475 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms