Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdx4Q07424 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms