Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Sh3bp2Q06649 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Sh3bp2Q06649 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp2Q06649 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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