Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms