Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai1Q02085 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms