Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd1Q01822 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms