Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps3aP97351 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3aP97351 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms