Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms