Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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