Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ptprn2P80560 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ptprn2P80560 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ptprn2P80560 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ptprn2P80560 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ptprn2P80560 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptprn2P80560 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ptprn2P80560 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms