Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd13P70217 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms