Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp46P62069 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms