Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ube2kP61087 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms