Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ube2mP61082 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms