Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp1P59054 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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