Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
GferP56213 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
GferP56213 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
GferP56213 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
GferP56213 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
GferP56213 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
GferP56213 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
GferP56213 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
GferP56213 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
GferP56213 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
GferP56213 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
GferP56213 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
GferP56213 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
GferP56213 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
GferP56213 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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