Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PctpP53808 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PctpP53808 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PctpP53808 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PctpP53808 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PctpP53808 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PctpP53808 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PctpP53808 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PctpP53808 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms