Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FmodP50608 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FmodP50608 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FmodP50608 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms