Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SftpbP50405 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SftpbP50405 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SftpbP50405 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SftpbP50405 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpbP50405 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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