Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Tmod1P49813 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmod1P49813 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmod1P49813 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmod1P49813 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmod1P49813 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tmod1P49813 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tmod1P49813 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tmod1P49813 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tmod1P49813 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tmod1P49813 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tmod1P49813 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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