Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl11P48298 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms