Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx1-2P42580 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms