Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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