Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms