Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PpargP37238 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PpargP37238 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PpargP37238 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms