Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rab5cP35278 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5cP35278 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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