Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc5P32043 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms