Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Hoxc11P31313 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxc11P31313 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxc11P31313 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxc11P31313 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxc11P31313 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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