Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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