Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms