Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BgnP28653 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BgnP28653 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BgnP28653 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BgnP28653 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BgnP28653 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms