Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms