Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18529 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18529 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18529 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms