Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou4f1P17208 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms