Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms