Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RhoP15409 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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RhoP15409 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RhoP15409 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RhoP15409 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RhoP15409 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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RhoP15409 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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RhoP15409 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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