Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Itga5P11688 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Itga5P11688 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms