Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RaraP11416 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RaraP11416 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaraP11416 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaraP11416 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RaraP11416 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RaraP11416 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RaraP11416 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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