Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms